仁济东院位于浦东陆家嘴金融贸易区内，1999年10月建成投入使用，占地86875平方米，建筑面积206859平方米。 仁济医院于1999年落户浦东，作为当时浦东新区唯一家三级甲等医院，为浦东地区居民和周边百姓获得优质医疗服务资源提供了切实的保障。随着浦东开发开放速度加快，浦东地区人口导入逐年增加，2011年常住人口超过500万。来院就诊病人快速攀升，至2012年日均病人流量超过8000人次，年门急诊量从57万人次递增到203万人次，对医院就医环境与服务空间都带来了巨大的压力和挑战。 为了满足日益增长的浦东居住人口医疗服务的需求，2005年仁济东院外科大楼建成并投入使用，核定床位1000张；2008年干部保健综合楼建成并投入使用；2008年12月仁济医院三期工程新门急诊医技综合楼作为上海市政府重大实事工程破土动工，2012年11月，仁济东院新门急诊大楼落成，总建筑面积5.95万平方米，比原先扩大3倍，在服务环境与诊疗设施等方面都得到很大的提升，为更多的病人获得优质医疗服务以及缓解群众看病就医困难做出更大的贡献。 仁济西院地处上海市黄浦区中央商务区，毗邻外滩，目前占地面积为7811㎡，总建筑面积为31959㎡，开放床位共460张，年门诊量达79万人次，出院1.7万人次，手术1.1万例。 医院设有39个临床科室。在坚持强化老牌优势专科的同时，仁济西院不断探索多科协作与资源整合，努力发展新兴学科和亚专业。特色专科主要包括:消化内科、风湿病科、泌尿外科、功能神经科、妇科肿瘤科、头颈外科、产科、重症监护室（ICU）。 其中，消化内科是国家临床重点专科和上海市消化内科临床医学中心，精于消化道肿瘤和癌前疾病、幽门螺杆菌及其相关疾病、慢性肝病（肝纤维化和非病毒性肝病）的诊断和防治研究，年门急诊量居国内第一，总体处于国内领先地位，某些领域达国际先进水平。 风湿病科是国内最早研究风湿病专业的单位之一，目前为上海市风湿病学临床医学中心，在国内率先建立多种早期诊断红斑狼疮等风湿病的抗体谱，经过数十年的研究探索，建有风湿病红斑狼疮病例的国际标准大型数据库，能够开展风湿病前沿诊疗技术，如关节B超、双光子骨密度仪、临床药物试验，创立风湿病医疗健身中心，建成上海市自身抗体参比实验室，进行免疫吸附治疗重症风湿病、SLE合并妊娠等最新课题研究。 泌尿外科是国内年门急诊量、手术量首屈一指的大型泌尿外科临床诊疗中心，以腹腔镜和微创为重点技术，建有完善的亚专业小组，针对性地开设了前列腺肿瘤、膀胱肿瘤、造口门诊和尿频尿急专病门诊。